Informační systém výzkumu,
vývoje a inovací

Centrální evidence projektů

Rozšířené vyhledávání

Zpět na hledáníGA21-31806S - Ovlivnění strukturních a funkčních charakteristik chaperonu HSP90 prostřednictvím reverzibilní acetylace (2021-2023, GA0/GA)

Identifikační kód GA21-31806S
Důvěrnost údajů S - Není předmětem státního či obchodního tajemství a data lze v souladu s právními předpisy poskytnout do veřejně přístupných informačních systémů včetně mezinárodních
Název projektu v původním jazyce Ovlivnění strukturních a funkčních charakteristik chaperonu HSP90 prostřednictvím reverzibilní acetylace
Název projektu anglicky Modulation of structural and functional properties of the HSP90 chaperone machinery by reversible acetylation
Poskytovatel GA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR)
Program GA - Standardní projekty  (1993 - 2050)
Kategorie VaV ZV - Základní výzkum
Hlavní vědní obor 10608 - Biochemistry and molecular biology
Vedlejší vědní obor -
Další vedlejší vědní obor -
Zahájení řešení 01.01.2021
Ukončení řešení 31.12.2023
Datum posledního uvolnění účelové podpory 07.03.2023
Číslo smlouvy 21-31806S
Poslední stav řešení O - Ukončený projekt s odloženým hodnocením, který byl ukončen v roce předcházejícím roku sběru dat, uvádí se údaje o projektu za poslední rok řešení, dodávají se údaje pro ukončené a zastavené projekty (relevantní pouze pro typ programu G – grantový program)
tis. Kč **
Finance projektu
202120222023celkem
Výše podpory z národních zdrojů3 009 000,0030093 093 000,0030933 033 000,0030339 135 000,009135
Výše podpory z veřej. zahraničních zdrojů ***0,0000,0000,0000,000
Celkové uznané náklady3 009 000,0030093 093 000,0030933 033 000,0030339 135 000,009135
Typčerpanéčerpanéčerpané

** Finance v tisících Kč jsou automaticky zaokrouhleny z částky v jednotkách Kč s přesností na 2 desetinná místa
*** Výše podpory z veřejných zahraničních zdrojů je sledována od období sběru 2020

Zobrazit skutečně čerpané finance projektu z národních zdrojů »

Druh soutěže VS - Veřejná soutěž
Veřejná soutěž ve výzkumu, vývoji a inovacích SGA0202100005 - Veřejná soutěž (GA0/GA)
Cíle řešení v původním jazyce Protein teplotního šoku 90 (HSP90) je molekulární chaperon, který zajišťuje buněčnou proteostázu. Funkce HSP90 je regulována množstvím posttranslačních modifikací, včetně acetylace lysinu. Biologické experimenty ukazují, že histon deacetyláza 6 (HDAC6) je nejen hlavní deacetylázou, ale také „klientem“ HSP90. Molekulární mechanismus, jakým dochází k ovlivnění funkce HSP90 dynamickou acetylací, však nebyl dosud objasněn. Pro objasnění strukturních a funkčních důsledků acetylace HSP90 využijeme metody syntetické biologie, strukturní a biofyzikální techniky a buněčná stanovení. S využitím technologie expanze genetického kódu připravíme acetylované varianty HSP90 a porovnáme jejich vlastností s neacetylovanými protějšky, identifikujeme histondeacetylasy zodpovědné za deacetylaci HSP90 a detailně charakterizujeme interakce mezi HSP90 a HDAC6. Data by měla poskytnout mechanistické vysvětlení toho, jak reversibilní acetylace reguluje buněčné funkce HSP90 a jak je v tomto ohledu zapojena HDAC6.
Cíle řešení v anglickém jazyce Heat shock protein 90 (HSP90) is a molecular chaperone regulating cellular proteostasis and its functions are modulated by a host of post-translational modifications, including lysine acetylation. Biological data suggest that histone deacetylase 6 (HDAC6) is a principal deacetylase and a client protein of HSP90, but structural basis of HSP90 (de)acetylation by HDAC6 and functional consequences of such interactions have not been studied. We will use synthetic biology, structural and biophysical techniques, and cell-based assays to elucidate structural and functional consequences of HSP90 acetylation. Specifically, we will purify acetylated HSP90 variants using the genetic code expansion technology and compare their properties to non-acetylated counterparts, identify histone deacetylases responsible for HSP90 deacetylation, and characterize in detail interactions between HSP90 and HDAC6. Our data shall provide mechanistic underpinnings of how cellular functions of HSP90 are regulated by reversible lysine acetylation with the special focus on the involvement of HDAC6.
Klíčová slova v anglickém jazyce Histone deacetylase;heat shock protein;protein-protein interactions;non-canonical aminoacids;acetyllysine;structural biology;genetic code expansion;microscale thermophoresis
Kontrolní číslo stavu projektu v letech 2021: 190723614 ( v1.0 )
2022: 190738875 ( v2.0 )
2023: 190742698 ( v1.0 )
2024: 190757932 ( v1.0 )
Datum dodání posledního záznamu o projektu 21.05.2024
Systémové označení dodávky dat CEP24-GA0-GA-R

Účastníci projektu

Počet příjemců 1
Počet dalších účastníků projektu 0
Příjemce Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i.
RIS ZED - ID Akce Z210101001095 (externí ID: GA2131806S_86652036, agregační ID: Z210101000000, rpd)
ŘešitelRNDr. Cyril Bařinka, Ph.D. (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 8147388)

tis. Kč **
Finance účastníků projektuPoznámka: Finance účastníků projektu jsou sledovány od roku 2007, investiční prostředky od roku 2013, prostředky ze zahraničních zdrojů od roku 2020

Celkové uznané náklady202120222023
Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i.3 009 000,0030093 093 000,0030933 033 000,003033
Výše podpory z národních zdrojů202120222023
Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i.3 009 000,0030093 093 000,0030933 033 000,003033
Výše podpory z veřejných zahraničních zdrojů202120222023
Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i.0,0000,0000,000
Investiční prostředky z podpory ze státního rozpočtu na účastníka v daném roce202120222023
Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i.0,0000,0000,000

** Finance v tisících Kč jsou automaticky zaokrouhleny z částky v jednotkách Kč s přesností na 2 desetinná místa

Zobrazit skutečně čerpané prostředky z národních zdrojů na účastníka »

Výsledky projektu v RIV

Počet výsledků projektu v RIV celkem 8
Výsledek druhu J RIV/86652036:_____/22:00555060 - Synthesis, Molecular Docking and Biological Characterization of Pyrazine Linked 2-Aminobenzamides as New Class I Selective Histone Deacetylase (HDAC) Inhibitors with Anti-Leukemic Activity (2022)
Výsledek druhu J RIV/86652036:_____/22:00556614 - Characterization of the class IIa histone deacetylases substrate specificity (2022)
Výsledek druhu J RIV/86652036:_____/22:00558797 - Uncovering Robust Delactoylase and Depyruvoylase Activities of HDAC Isoforms (2022)
Výsledek druhu J RIV/86652036:_____/23:00568950 - In-solution structure and oligomerization of human histone deacetylase 6-an integrative approach (2023)
Výsledek druhu J RIV/86652036:_____/23:00571548 - Selectivity of Hydroxamate- and Difluoromethyloxadiazole-Based Inhibitors of Histone Deacetylase 6 In Vitro and in Cells (2023)
Výsledek druhu J RIV/86652036:_____/23:00571923 - Continuous Fluorescent Sirtuin Activity Assay Based on Fatty Acylated Lysines (2023)
Výsledek druhu J RIV/86652036:_____/23:00574532 - Comprehensive Mechanistic View of the Hydrolysis of Oxadiazole-Based Inhibitors by Histone Deacetylase 6 (HDAC6) (2023)
Výsledek druhu C RIV/86652036:_____/23:00578923 - Determining Potency of Inhibitors Targeting Histone Deacetylase 6 by Quantification of Acetylated Tubulin in Cells (2023)
Vyhledávání ...