Zpět na hledáníComplete genome sequences of blueberry red ringspot virus (Caulimoviridae) isolates from the Czech Republic and Slovenia (2011)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/60077344:_____/11:00367250 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Complete genome sequences of blueberry red ringspot virus (Caulimoviridae) isolates from the Czech Republic and Slovenia |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | - |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | E - Biovědy |
| Obor | EE - Mikrobiologie, virologie |
| Rok uplatnění | 2011 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 1 |
| Počet tvůrců celkem | 4 |
| Počet domácích tvůrců | 3 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Karel Petrzik (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6051448) Jaroslava Přibylová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 2845768) Josef Špak (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9037098) I. Mavrič-Pleško (státní příslušnost: SI - Slovinská republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Genomic DNA of blueberry red ringspot virus (genus Soymovirus, family Caulimoviridae) from highbush blueberry plants growing for years in the Czech Republic and Slovenia was sequenced. The circular dsDNA genomes consist of 8,303 and 8,299 nt, respectively, and contain eight open reading frames (ORFs) longer than 100 amino acids. The European isolates are 90% to 99% identical in aa sequences of distinct proteins. In contrast to the American New Jersey isolate, in-frame initiation codons have been found upstream from AUG codons of ORFs I, IV and V in the European isolates. These and other differences resulted in a longer capsid protein, reverse transcriptase, movement protein and protein the encoded by ORF VII and reduced (75.4% to 93.7%) amino acid identity with corresponding proteins of the New Jersey isolate. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | Complete genome; blueberry virus; highbush blueberry |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| DOI výsledku | 10.1007/s00705-011-1077-x |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Archives of Virology |
|---|---|
| ISSN | 0304-8608 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 156 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 10 |
| Stát vydavatele periodika | AT - Rakouská republika |
| Počet stran výsledku | 3 |
| Strana od-do | 1901-1903 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000296510200026 |
| EID výsledku v databázi Scopus | - |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Biologické centrum AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodavatel | AV0 - Akademie věd České republiky (AV ČR ) |
| Rok sběru | 2012 |
| Specifikace | RIV/60077344:_____/11:00367250!RIV12-AV0-60077344 |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 29.05.2012 |
| Kontrolní číslo | 13185997 |