Identifikační kód |
RIV/86652036:_____/13:00398761 |
Název v anglickém jazyce |
Heterogeneity of Astrocytes: From Development to Injury - Single Cell Gene Expression |
Druh |
J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
Poddruh |
- |
Jazyk |
eng - angličtina |
Obor - skupina |
E - Biovědy |
Obor |
EB - Genetika a molekulární biologie |
Rok uplatnění |
2013 |
Kód důvěrnosti údajů |
S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
Počet výskytů výsledku |
4 |
Počet tvůrců celkem |
6 |
Počet domácích tvůrců |
2 |
Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců |
Mikael Kubista (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3757501) Vendula Rusňáková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 8664595) Miroslava Anděrová (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Dávid Džamba (státní příslušnost: SK - Slovenská republika) Pavel Honsa (státní příslušnost: CZ - Česká republika) A. Stahlberg (státní příslušnost: SE - Švédské království) |
Popis výsledku v anglickém jazyce |
Astrocytes perform control and regulatory functions in the central nervous system; heterogeneity among them is still a matter of debate due to limited knowledge of their gene expression profiles and functional diversity. To unravel astrocyte heterogeneity during postnatal development and after focal cerebral ischemia, we employed single-cell gene expression profiling in acutely isolated cortical GFAP/EGFP-positive cells. Using a microfluidic qPCR platform, we profiled 47 genes encoding glial markers andion channels/transporters/receptors participating in maintaining K+ and glutamate homeostasis per cell. Self-organizing maps and principal component analyses revealed three subpopulations within 10-50 days of postnatal development (P10-P50). The first subpopulation, mainly immature glia from P10, was characterized by high transcriptional activity of all studied genes, including polydendrocytic markers. The second subpopulation (mostly from P20) was characterized by low gene transcript l |
Klíčová slova oddělená středníkem |
Single cell expression profiling; astrocytes; GenEx |
Stránka www, na které se nachází výsledek |
- |
DOI výsledku |
10.1371/journal.pone.0069734 |
Odkaz na údaje z výzkumu |
- |