Zpět na hledáníCalculation of clusters of hydrated amino-acid conformers (2014)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/86652036:_____/14:00451604 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Calculation of clusters of hydrated amino-acid conformers |
| Druh | R - Software |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | B - Fyzika a matematika |
| Obor | BO - Biofyzika |
| Rok uplatnění | 2014 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 3 |
| Počet tvůrců celkem | 1 |
| Počet domácích tvůrců | 1 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Lada Biedermannová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 2785056) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Program downoads specified set of structures from the Protein Data Bank (PDB), performs structure quality check, adds neighboring crystallographic cells, extracts water molecules in the vicinity of the selected protein chain, analyzes protein-water contacts, water-amino-acid-residue distance distributions and residue SASA distributions, and classifies and clusters residue conformations based on secondary structure and rotameric state.n n |
| Klíčová slova oddělená středníkem | protein hydration; structural biology; X-ray crystallography, data mining; conformational clustering |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | http://www.dnatco.org/atlas/cluster/ |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Interní identifikační kód produktu přidělený tvůrcem | cluster.sh |
|---|---|
| Technické parametry | BASH script, licence GPL 3 |
| Ekonomické parametry | typový projekt |
| IČ vlastníka výsledku | 86652036 |
| Název vlastníka | Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i. |
| Druh možnosti využití výsledku | P - Využití výsledku jiným subjektem je v některých případech možné bez nabytí licence |
| Požadavek na licenční poplatek | N - Poskytovatel licence na výsledek nepožaduje licenční poplatek |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodavatel | AV0 - Akademie věd České republiky (AV ČR ) |
| Rok sběru | 2016 |
| Specifikace | RIV/86652036:_____/14:00451604!RIV16-AV0-86652036 |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 11.05.2016 |
| Kontrolní číslo | 191770376 ( v1.0 ) |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem
| Dodáno MŠMT v roce 2016 | RIV/86652036:_____/14:00451604 v dodávce dat RIV16-MSM-86652036/01:1 |
|---|---|
| Dodáno GA ČR v roce 2016 | RIV/86652036:_____/14:00451604 v dodávce dat RIV16-GA0-86652036/01:1 |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Výzkumný záměr podporovaný AV ČR | AV0Z50520701 - Vybudování Biotechnologického ústavu AV ČR (2007 - 2013) |
|---|---|
| Podpora / návaznosti | Institucionální podpora na rozvoj výzkumné organizace |